新版本明确将“新型冠状病毒感染”纳入乙类传染病管理，并新增“猴痘”为乙类传染病。

丙类传染病新增“手足口病”。

调整程序更加细化，突发传染病可临时按甲类管理。

新增“多点触发、智慧化监测预警体系”，整合多部门数据共享。

明确“网络直报”为强制要求，并新增检验检测机构报告义务。

新增条款明确传染病防治中个人信息处理的合规要求，如不得过度收集、保障安全。

新增加强中西医结合的内容，强调发挥中医药在传染病防治中的作用。

新增要求公告措施内容、范围及期限，并保障基本生活与特殊群体照顾。

要求设区的市级政府确定医疗废物协同应急处置设施。

对拒不配合防控措施、故意传播传染病等行为的罚款及吊销执照等处罚更加明确。

新增建立病原微生物菌（毒）种保藏库，实行分类管理制度。

新增国家支持和鼓励传染病防治的国际交流与合作。

新增建立重大疫情心理援助制度，要求政府组织专业力量提供心理疏导。

新增要求用人单位保留隔离期间劳动者的岗位并支付工资。